Фамилия Бенимус — редкий пример того, как еврейская фамилия ашкеназского происхождения «законсервировала» в себе латинский язык. В основе лежит латинское слово «benignus» — «добрый», «милостивый», «благожелательный». В идише и разговорной речи ашкеназов оно превратилось в «Бенимус» (Benimus) — через закономерный переход звуков и влияние произносительной нормы. Так что значение фамилии — «добрый человек», «благожелатель».

Модель образования проста: это не патроним (не от имени отца) и не топоним. Это искусственная «благозвучная» фамилия, которую еврейские семьи нередко брали в XIX веке при обязательной паспортизации в Российской империи или Австро-Венгрии. Выбор пал на слово с положительным смыслом на латыни — языке науки и официальных документов. Подобные фамилии (Бенигн, Бенигнус, Бенимус) встречаются в еврейских общинах Восточной Европы, но Бенимус — одна из самых компактных и редких форм.

Окончание -ус в русской передаче — это латинское окончание именительного падежа, которое в фамилии сохранили как дань «учёному» звучанию. В бытовой речи его могли русифицировать в Бенимов или Бенимусов, но первоначальная запись удержалась. В дореволюционных метрических книгах такая фамилия встречается преимущественно в черте оседлости — на территориях современных Украины, Беларуси, Польши.

Носители фамилии Бенимус — это, скорее всего, потомки еврейских мещан или купцов, которые при получении фамилии выбрали слово, подчёркивающее добрый нрав или пожелание удачи. Сегодня фамилия остаётся крайне малочисленной, её можно встретить в России, Израиле и США. Устойчивой дворянской или крестьянской истории у неё нет — это сугубо городская, канцелярская фамилия, закреплённая за конкретным родом.