Скорее всего, Бенубис образована от аналогичного прозвища. По одной из версий, оно происходит от румынского слова băni - «возводить в чин бана (наместника, правителя)». Следовательно, это прозвище могло указывать на социальное положение основателя рода Бенубис. Согласно другой гипотезе, прозвище Бенубис происходит от слова bănui - «подозревать, не доверять». В таком случае оно указывало на подозрительный характер человека.