Фамилия Бэран — редкий для России случай, когда написание через «э» не случайная ошибка, а ключ к происхождению. В русской письменной традиции фамилии, начинающиеся на «Бэ», почти всегда указывают на нерусские корни: тюркские, кавказские или западноевропейские. В данном случае основа, скорее всего, тюркская: слово «баран» (бара́н) во многих тюркских языках означает «овца», «баран». Фамилия Бэран — это фонетический вариант, который закрепился на письме, возможно, под влиянием западных языков (например, польского или немецкого), где звук «а» после твёрдого согласного мог передаваться как «э».

Модель образования проста: прозвище Бэран (Баран) без дополнительного русского суффикса. Такие «чистые» основы характерны для фамилий, которые складывались на окраинах Российского государства, в среде казачества, или у народов, не входивших в центральную великорусскую антропонимию. Прозвище Баран мог получить человек упрямый, лохматый или, напротив, зажиточный скотовод. В тюркской среде прозвище могло быть связано с тотемным животным или служить оберегом.

Встречается фамилия Бэран в Западной Украине, Беларуси и Польше, где написание через «э» нормально для передачи тюркского звучания. Есть и версия, что это вариант еврейской фамилии Бер (медведь на идише), но она менее вероятна: Бер в славянской записи обычно даёт Бэр, а не Бэран, и суффикс -ан нехарактерен для ашкеназских фамилий.

О сословной принадлежности носителей сказать определённо трудно. Скорее всего, предки были крестьянами или казаками, не имевшими дворянского титула. В дворянских родословных книгах такая фамилия не зафиксирована, что косвенно подтверждает её простонародное или инородческое происхождение.