Фамилия Бетхиненко — редкий случай, когда украинская модель образования накладывается на немецкую основу. Это не двойная фамилия и не позднее заимствование: суффикс -енко, типичный для восточной и центральной Украины, указывает на происхождение от человека по имени или прозвищу Бетхина. Вопрос в том, что скрывается за этим корнем.

Скорее всего, в основе лежит немецкая фамилия Бетхин (Böthin, Bethin) или её вариант Бетке (Bethke). В XVII–XIX веках в Российской империи, особенно на юге и в Новороссии, оседали немецкие колонисты — ремесленники, фермеры, специалисты. Их фамилии нередко адаптировались местным населением: немецкое окончание заменялось на славянское, а само имя могло стать прозвищем. Бетхиненко — буквально «сын (или потомок) Бетхина». В украинской ономастике суффикс -енко исторически означал именно отчество или принадлежность к роду.

Есть и менее вероятная версия: корень может восходить к диалектному слову «беть» (бить, колотить) или к тюркскому «бет» (лицо, сторона), но в сочетании с суффиксом -ин- и украинским окончанием это выглядит натянуто. Немецкое происхождение объясняет и редкость фамилии: такие гибридные формы возникали точечно, в конкретных сёлах или местечках, где жила одна-две семьи переселенцев.

Фамилия Бетхиненко не упоминается в классических словарях русских фамилий (Унбегаун, Никонов), что подтверждает её локальный и, вероятно, поздний характер. Носители этой фамилии сегодня встречаются в основном на востоке Украины и в прилегающих областях России — это след той самой волны немецкой колонизации XVIII–XIX веков. Сословно предки могли быть как крестьянами-арендаторами, так и мещанами или ремесленниками, но точных данных об этом нет.