Фамилия Бейбитхан — редкий пример фамилии, которая не перешла в русскую модель через суффикс (-ов, -ин), а сохранила исходную форму восточного имени. Её основа — казахское или тюркское мужское имя Бейбитхан, состоящее из двух частей: «бейбит» (мир, спокойствие) и «хан» (властитель, правитель). Таким образом, имя в целом означало «мирный правитель» или «хан, несущий покой». В казахской ономастике такие имена давали с пожеланием, чтобы человек был справедливым и умиротворяющим лидером.

Фамилия образована напрямую от этого имени без дополнительных русских фамильных суффиксов. Это характерно для фамилий народов Центральной Азии, которые в советское время при паспортизации часто фиксировались в исходном виде — как имя отца или деда. То есть предок носителя фамилии, скорее всего, был известен под именем Бейбитхан, и это имя закрепилось за его потомками как родовое прозвание. В отличие от русских фамилий, где суффикс указывает на принадлежность («чей?»), здесь фамилия просто повторяет имя.

Географически фамилия Бейбитхан почти наверняка связана с Казахстаном. Встречается она редко, в основном среди казахов. В русском языке ударение, вероятно, падает на последний слог — Бейбитха́н, хотя в оригинале возможно ударение на первый слог (Бе́йбитхан). Из-за арабской графики и разницы в транслитерации возможны варианты написания: Бейбетхан, Бейбит-хан, но основной вариант закрепился именно как Бейбитхан.

С социальной точки зрения, фамилия указывает на то, что предки не принадлежали к русскому дворянству или крестьянству — это фамилия советского периода, когда фиксировали национальные имена. В дореволюционных метрических книгах её бы не было. Если искать корни, стоит обращаться к казахским родословным (шежире) и архивам ЗАГСов Казахстана. Никакой другой этимологии, кроме как от имени «мирный хан», у этой фамилии нет — это не прозвище по профессии и не топоним.