Фамилия Бейшалиева — женская форма фамилии Бейшалиев, а та, в свою очередь, образована от мужского личного имени Бейшали. Это составное имя, распространённое у тюркских народов (особенно у киргизов, казахов, узбеков, туркмен, а также у татар и башкир). Первая часть — «бей» (в тюркских языках «господин», «князь», «вождь»), вторая — «шали» (арабское имя Шали, один из вариантов имени Шахид или уменьшительная форма от Шайх-Али). В целом имя Бейшали можно перевести как «господин Шали» или «князь, подобный Шали».

Поскольку фамилия оканчивается на -ева, это русский патронимический суффикс, который в XIX–XX веках добавляли к тюркским именам при русификации. В самой Средней Азии и Казахстане фамилии часто заканчиваются на -ев/-ова, но произносятся с ударением на последний слог. В русской среде ударение в фамилии Бейшалиева, скорее всего, падает на второй слог: Бейша́лиева.

Носители фамилии — потомки человека по имени Бейшали. Скорее всего, это был не просто рядовой кочевник, а уважаемый человек, возможно, аксакал или батыр, поскольку компонент «бей» указывает на знатное происхождение или на лидерские качества. Фамилия Бейшалиева встречается в основном на юге Кыргызстана (Ошская, Джалал-Абадская области), а также среди киргизской диаспоры в Узбекистане и Таджикистане. В России она редка и фиксируется в основном у мигрантов из Средней Азии.

Интересная деталь: в отличие от многих тюркских фамилий, оканчивающихся на -ов/-ев, у Бейшалиевой нет «застывшего» ударения на последнем слоге в русском произношении. Это говорит о том, что фамилия вошла в русский язык относительно недавно, и её носители сохраняют исходное ударение имени Бейшали.