Фамилия Безушкин — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка связано с физической особенностью или манерой поведения, а не с именем или профессией. Корень здесь — «ух» (ухо), а приставка «без-» указывает на отсутствие. В старину человека, лишённого уха или с маленькими, неразвитыми ушными раковинами, могли прозвать Безух или Безушко. Суффикс «-кин» (фонетический вариант «-ин») в русской антропонимии означает принадлежность: «чей?» — «Безушкин», то есть сын, потомок Безушки.

Версия, что прозвище могло относиться к человеку, который «пропустил мимо ушей» какой-то приказ или совет — то есть был непослушным или рассеянным, — тоже имеет право на существование. В говорах «безухий» иногда означало «глуховатый» или «не желающий слышать». Однако прямая физическая примета (шрам от боя, увечье или просто заметная асимметрия) в крестьянской среде давала прозвища гораздо чаще, чем метафора.

Фамилия образована по продуктивной модели: основа на согласный плюс суффикс -ин. Сравните: Безносов — от «безносый», Безрукавин — от «безрукавый» (без рукавицы). В отличие от фамилий на -ов (Безруков), форма на -ин чаще встречалась в северных и центральных губерниях России и в среде непривилегированных сословий. Безушкин — фамилия недворянская, скорее крестьянская или мещанская, и в дореволюционных списках встречается спорадически.

Стоит отметить, что в документах XVII века встречаются прозвища Безух (например, крестьянин Безух из новгородских писцовых книг), но фамилия Безушкин — более поздняя, «патронимическая» переделка от уменьшительной формы Безушка. То есть сначала человека звали Безух, его сына — Безушко (в ласкательном или пренебрежительном смысле), а уже внук записался как Безушкин.