Фамилия Биксяляева — редкая и с трудом поддаётся однозначному толкованию в рамках славянской ономастики. Её основа явно не русского, а тюркского происхождения. Скорее всего, она восходит к мужскому имени Биксяляй или прозвищу Биксяляй, которое, в свою очередь, сложилось из двух частей: «бик» (от тюркского «бек» — господин, князь) и «сяляй» (вариант имени «Салих» или «Саляй» — праведный, благочестивый, что в переводе с арабского означает «добрый», «порядочный»). Таким образом, имя Биксяляй могло означать «князь-праведник» или «господин добрый» — типичная для тюркских народов составная антропонимическая модель, где первая часть указывает на социальный статус, а вторая — на личное качество.

Географически фамилия привязана к Поволжью и Приуралью. Она характерна для татар, башкир и отчасти для чувашей (в чувашском языке «пик» — «крепкий», «сильный», что могло дать похожее звучание). Аффикс «-яев» в окончании (вместо привычного русского «-ов») — это русифицированная форма тюркского патронимического суффикса, указывающая на принадлежность к роду: Биксяляев буквально значит «сын Биксяляя». Женская форма Биксяляева закрепилась как стандартное окончание для замужних женщин и дочерей.

Версия о происхождении от прозвища, связанного с каким-либо ремеслом или внешностью, маловероятна: слишком прозрачна именная конструкция. Спорным остаётся лишь вопрос, было ли имя Биксяляй каноническим мусульманским или народно-бытовым. Судя по тому, что вторая часть («сяляй») — это адаптация арабского «Салих», имя могло быть вполне религиозным, хоть и в местном произношении.

По сословной принадлежности носители фамилии, скорее всего, относились к государственным или ясачным крестьянам, реже — к служилым татарам (мурзам). В метрических книгах и ревизских сказках XIX века фамилия встречается в Казанской, Уфимской и Оренбургской губерниях. Известных исторических деятелей с этой фамилией нет, что типично для фамилий, не попавших в дворянские родословные книги.

Коротко: фамилия Биксяляева образована от тюркского составного имени со значением «господин праведный», распространена среди татар и башкир, а её окончание — результат русификации.