Фамилия Блишун — редкий случай, когда прозвищное имя сохранилось почти без изменений, без типичных русских суффиксов -ов или -ин. Основа фамилии — прозвище Блишун, и у него есть два основных объяснения. Первое ведет на Украину: от уменьшительных форм «блiша», «блiшка» — «блоха». Прозвище могли дать человеку невысокого роста или, наоборот, непоседе, любителю попрыгать и порезвиться. Второе объяснение — белорусское, от глагола «блішчэць» (блестеть, сверкать). Здесь Блишуном называли щеголя, человека с безупречным внешним видом, либо остроумца, чьи слова «сверкали», как искры.

Сама словообразовательная модель — суффикс -ун — в восточнославянских фамилиях встречается нечасто. Он образует имена деятеля от глаголов (скакун, ворчун) или прозвища по характерному признаку. В случае с Блишуном суффикс подчеркивает, что прозвище было не случайным, а описывало устойчивое качество или поведение человека. Сравните с фамилиями Блохин, Блоха — они образованы от той же основы «блоха», но с другим суффиксом.

Географически фамилия Блишун тяготеет к западнорусским землям, к зоне контакта украинского и белорусского языков. Встречается она в основном на юго-западе России, в Беларуси и на востоке Украины. Именно в этих регионах оба корневых слова — «блоха» и «блестеть» — звучали естественно для носителей местных говоров. Таким образом, предки носителя фамилии Блишун были либо юркими и подвижными людьми, либо, напротив, заметными и блистательными — в зависимости от того, какое из двух значений закрепилось за прозвищем.