Фамилия Бобруенко — яркий пример украинской модели фамилий с суффиксом -енко, который в XVI–XVII веках был основным способом обозначения сына или потомка по отцу (буквально «маленький Бобруй» или «сын Бобруя»). В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, где основа чаще всего была полным именем или прозвищем, украинские -енко образовывались от прозвищ, названий животных или профессий. В основе Бобруенко лежит прозвище Бобруй или Бобр, которое могло указывать на внешнее сходство с бобром (коренастый, с окладистой бородой, трудолюбивый) либо на занятие — бобровый промысел был распространён на Полесье и в Черниговщине.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям Украины: Черниговщина, Киевщина, Полтавщина. В XIX веке Бобруенко фиксируются преимущественно среди крестьян и казаков, а не шляхты, что соответствует социальной природе суффикса -енко — он был массовым именно в непривилегированных слоях. Интересно, что в метрических книгах XIX века встречаются варианты написания: Бобруенко, Бобруенков (с русификацией окончания), а также Бобруев — это следы канцелярской адаптации при переселении в великорусские губернии.

Спорный момент: могла ли фамилия произойти от топонима Бобруйск? Вероятность низкая. Суффикс -енко редко прикрепляется к названиям городов напрямую — скорее к личному прозвищу. Если бы предок был родом из Бобруйска, он получил бы фамилию Бобруйский или Бобруец. Поэтому основа «бобруй» здесь — именно прозвищное имя, а не географическая привязка. В словаре украинских прозвищ XVII века встречается имя Бобруй, что подтверждает эту версию.

Сравните с однокоренными фамилиями: Бобров — русская версия с суффиксом принадлежности, Бобренко — та же модель, но с усечением основы, Бобруев — вариант с адаптацией под русское -ев. Бобруенко стоит особняком: редкий случай, когда основа сохраняет полную форму прозвища с гласной на конце, что указывает на архаичность и местный говор. Носителей фамилии сегодня около полутора тысяч человек, большинство живут на Украине и в южных регионах России.