Фамилия Боеаджан — одна из тех, где ключ к разгадке лежит в географии, а не в славянской корневой системе. Её происхождение почти наверняка связано с армянским языком и культурой. Основа «Бое-» или «Бой-» в армянских фамилиях часто восходит к тюркскому или персидскому влиянию, но в данном случае точнее смотреть на конечную часть: «-джан» — это армянский уменьшительно-ласкательный суффикс, аналог русского «-еньк-» или «-ушк-». Он придаёт основе оттенок близости, уважения или нежности.

Сама основа «Боеа» (или «Боя») — скорее всего, вариант личного имени или прозвища. В армянской ономастике есть имя Боян (от тюркского «богатый», «могучий» или от древнеиранского «защитник»), а суффикс «-джан» мог превратить его в фамилию, означающую «сын (или потомок) Бояна» или «маленький Боян». Однако не исключена и другая версия: основа могла быть искажена при записи. В документах Российской империи армянские фамилии часто русифицировали, заменяя окончания. Если исходная фамилия звучала как «Бояджян» (с буквой «й»), то «Боеаджан» — это либо опечатка, либо диалектное произношение, где «й» перешло в «еа».

Словообразовательная модель здесь нетипична для русских фамилий. В ней нет привычных суффиксов -ов/-ев, -ин, -ский. Это чисто армянская модель: основа + суффикс «-ян» («-джан» как его вариант), указывающий на принадлежность к роду. Таким образом, фамилия Боеаджан означает «из рода Боеа» или «потомок Боеа». Кем был этот предок — сложно сказать. Если имя Боян, то он мог быть известным в своей общине человеком, возможно, воином или старейшиной, так как корень «бой» в тюркских языках часто связывали с силой и знатностью.

Географически фамилия редкая и, скорее всего, привязана к западноармянским диаспорам или к регионам, где армянское население смешивалось с тюркским (например, историческая Западная Армения на территории современной Турции). В современной России фамилия встречается единично, что подтверждает её узколокальное происхождение. Отсутствие варианта «Бояджян» в массовых базах говорит о том, что носители, вероятно, эмигрировали в русскоязычную среду уже с искажённой записью, либо фамилия прошла через канцелярскую ошибку при паспортизации в советское время.