Фамилия Богущенко звучит на украинский лад, и это первая подсказка. Суффикс -енко — характерный признак украинских фамилий, образованных по модели «чьего сына?». В дословном переводе «Богущенко» означает «сын Богуща» или «потомок Богуща». Основа здесь — неканоническое имя или прозвище Богуш, которое, в свою очередь, происходит от слова «бог». В украинской традиции это могло быть как сокращение от полного крестильного имени Богуслав (смысл — «Богом славный»), так и самостоятельное прозвище, данное набожному или очень религиозному человеку.

Версия с Богуславом выглядит наиболее вероятной. Имена с корнем «бог-» были популярны у славян, особенно в западнорусских землях и в Речи Посполитой, где украинские фамилии формировались под влиянием польского языка. Фамилия Богущенко легко вписывается в ряд однокоренных: Богушевский, Богушевич, Богуш. Разница между ними — в суффиксе, который указывает на социальную среду. Суффикс -енко в XVII–XVIII веках закрепился в первую очередь за казацкими и крестьянскими родами Левобережной Украины (Черниговщина, Полтавщина). Поэтому предок носителя фамилии Богущенко, скорее всего, был не шляхтичем, а казаком или мещанином, которого в документах записывали по отчеству.

Географически фамилия сегодня встречается не только на Украине, но и в южных областях России, куда она попала с волнами переселений. Встречается и вариант с ударением на второй слог — БогУщенко, что для украинских фамилий не редкость. Интересная деталь: в старых метрических книгах можно найти написание «Богущенко» через «и» — «Богущинко». Это не ошибка, а отражение местного произношения, когда суффикс -енко редуцировался до -инко в некоторых говорах. Такое написание — дополнительная зацепка для генеалогического поиска: оно указывает на конкретный регион, чаще всего на Харьковщину или Слобожанщину.