Фамилия Бокданова — редкий случай, когда написание не совпадает с привычным слуху вариантом. Скорее всего, перед нами не что иное, как фонетическая или орфографическая запись фамилии Богданова. В русских говорах, особенно в северных и сибирских, оглушение звонкого «г» перед глухим «д» — обычное дело: «Бохданов» или «Бокданов». Так фамилию могли записать в документах со слов носителя, не сверяясь с церковнославянским написанием имени Богдан.

Если это так, то основа фамилии — каноническое славянское имя Богдан, что значит «данный Богом». Оно было распространено в крестьянской и мещанской среде, особенно в XVI–XVII веках, когда подобные «говорящие» имена давали в обход святцев. Суффикс -ов указывает на принадлежность: Богданов — сын Богдана. Соответственно, Бокданова — женская форма от той же мужской фамилии.

Менее вероятная, но не исключённая версия — связь с диалектным словом «бокда» (или похожим), которое могло означать что-то вроде «боковой», «кривой» или относиться к местности. Однако в доступных словарях русских говоров такое слово не фиксируется, поэтому версия с искажением «Богдан» остаётся основной.

Интересно, что в некоторых регионах фамилию могли писать как Богдaнов, а в быту произносить «Бохданов». На письме это иногда закреплялось, особенно если грамотей был малограмотным или следовал местной произносительной норме. Таким образом, фамилия Бокданова — живой пример того, как устная традиция влияет на официальную запись, и её носители, скорее всего, потомки тех, кого в роду звали Богданами.