Фамилия Бородченко — один из ярких примеров того, как украинская модель фамилии закрепилась в русском именослове. Её основа — прозвище Бородка или Бородько, то есть человек с заметной, возможно окладистой, бородой, либо обладатель маленькой, «бородки» в переносном смысле. Суффикс -енко, характерный для Левобережной Украины и юга России, в XVI–XVIII веках выполнял роль отчества или указания на принадлежность к роду: Бородченко — «сын Бородки» или «маленький Бородка». В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, которые фиксируют имя отца в родительном падеже, украинские фамилии на -енко буквально означают «потомок того, кого звали Бородка».

В русских документах фамилия встречается с XVIII века, преимущественно в Курской, Воронежской и Харьковской губерниях — зоне активного смешения украинского и русского населения. Встречаются варианты написания: Бородченко, реже Бородченков (под влиянием русской модели). Стоит отметить, что в основе лежит не имя, а именно прозвище по внешнему признаку. Бородченко — не дворянская фамилия, её носителями были в основном крестьяне, казаки и мещане. В современных телефонных справочниках и базах данных фамилия остаётся редкой, но устойчиво встречается в Белгородской и Ростовской областях.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Бородченко стоит в одном ряду с Бородиным (русская модель с суффиксом -ин) и Бороденко (украинская без чередования). Фактически, все они восходят к одному прозвищному корню, но суффикс -енко в Бородченко — самый верный признак того, что фамилия оформилась именно в украинской языковой среде, а затем вошла в общерусский обиход.