Фамилия Борункова — женская форма фамилии Борунков, и её редкость сразу бросается в глаза. Если вглядеться в структуру, то перед нами не типичная «профессиональная» или «патронимическая» модель, а скорее прозвищная, с неочевидным корнем. Основа — «борун-» — в русских говорах могла означать человека с определённым характером или внешностью. В диалектах слово «борун» иногда связывали с глаголом «борать» (бороть, одолевать) или «бормотать» — то есть прозвище мог получить ворчун, неразборчиво говорящий человек. Вторая версия, менее распространённая, но имеющая место в ономастике, — отчество от нецерковного имени Борун, которое давали ребёнку, родившемуся во время борьбы или ссоры. Суффикс «-ков» указывает на принадлежность: Борунков — сын Боруна. Такая модель образования типична для северных и центральных русских регионов, где прозвища часто переходили в фамилии без изменений.

География фамилии узкая: основные носители встречаются в Вологодской и Архангельской областях, а также в Сибири, куда переселенцы уходили в XVII–XVIII веках. В дореволюционных переписях Борунковы фиксировались среди государственных крестьян и мещан — никакого дворянства или знатных родов за этой фамилией не числится. Любопытно, что фамилия почти не встречается в южнорусских говорах, что подтверждает её северное происхождение. В написании возможна путаница с фамилией Борунков (через «а»), но это разные корни: «барун» — от «бара» (овца) или тюркских заимствований. Борункова же остаётся чисто славянским вариантом, где прозвище предка, скорее всего, описывало его манеру речи или поведения.