Фамилия Бостубаев — яркий пример того, как географическое положение и этнический состав региона формируют фамильную модель. Её основа — тюркское имя Бостубай, которое состоит из двух частей: «босту» и «бай». Первая часть восходит к слову «бост» (или «бос»), что в ряде тюркских языков означает «серый», «сивый» (масть лошади) или «сильный, могучий». Вторая часть — «бай» (богатый, господин, хозяин) — типичный компонент в тюркских именах, указывающий на достаток или статус. Таким образом, имя Бостубай могло означать «серый (сивый) богач» (по аналогии с именем Бозбай) или «сильный господин».

Суффикс -ев в фамилии — не русский, а тюркский патронимический формант, адаптированный в русской записи. В казахском и других тюркских языках фамилии на -ев (или -ов) образуются от имени отца: Бостубай → Бостубаев — «сын Бостубая». Это одна из самых распространённых моделей для народов Центральной Азии, перешедших на русскую регистрацию фамилий в XIX–XX веках.

Географически фамилия Бостубаев чаще всего встречается в Казахстане, особенно в южных и западных областях (Жамбылская, Туркестанская, Мангистауская). Встречается она и в Кыргызстане, а также среди казахских диаспор в России (Оренбургская, Астраханская области). Среди носителей фамилии можно встретить людей разных профессий, но исторически предки могли быть скотоводами или воинами — имя Бостубай давали с пожеланием силы и богатства.

В русских официальных документах фамилия могла записываться по-разному: Бостубаев, Бостубай, Бостубаев (с двойным «б»). Вариант с одной «б» (Бостубаев) встречается реже, но возможен из-за особенностей произношения. Путаница иногда возникает из-за схожести с фамилией Бостубаев (от имени Бостубай) и Бостубаев (от «босту» + «бай»), но это одна и та же основа.