Фамилия Брахнин — это отчество второго порядка, образованное от личного прозвища Брахня с помощью патронимического суффикса -ин. По своей модели она стоит в одном ряду с такими фамилиями, как Петин, Ванин, Кузьмин, но её основа не крестильное имя, а прозвище. Это сразу указывает на то, что первый носитель фамилии был сыном или внуком человека, известного в своей общине под именем Брахня.

Значение прозвища двойственное, и обе версии имеют лингвистическую опору. Первая отсылает к белорусскому слову «брахня» — «ложь, клевета». В этом случае Брахней могли назвать краснобая, любителя приврать или сплетника. Вторая версия связывает прозвище с белорусским глаголом «брахнуць» (или «бракнуць») — «мокнуть, напитываться влагой». Тогда прозвище могло закрепиться за человеком, жившим у болота, на сырой низине, или за тем, кто постоянно работал в воде (например, рыбак, бондарь, вымачивавший древесину). Выбрать одну из версий без данных о географии бытования фамилии сложно, но обе они реалистичны и укладываются в народную традицию прозваний по характерному признаку или месту жительства.

Примечательно, что корень «брах-» имеет параллели и в других славянских языках. В польском и чешском «bracha» означает «брак, изъян», что могло бы дать ещё одну, более редкую трактовку: Брахня — человек с физическим недостатком. Однако для фамилии Брахнин эта версия менее вероятна, так как основная масса носителей сосредоточена в западнорусских и белорусских землях, где именно белорусские значения «ложь» и «мокнуть» являются первичными.

Фамилия Брахнин — редкая. Она не встречается в массовых списках дворянских или купеческих родов, что говорит о крестьянском или мещанском происхождении её первых носителей. В дореволюционных переписях такую фамилию могли получить люди из одной конкретной деревни или волости, где жил родоначальник Брахня. Точное место возникновения фамилии сегодня установить не удаётся, но её белорусские корни — надёжный ориентир для генеалогического поиска.