Фамилия Брунецкий — одна из тех, где корень прозрачен, а суффикс указывает на географическое или сословное происхождение. Основа «брун-» напрямую отсылает к польскому или западнорусскому слову «брунет» (смуглый, темноволосый человек). В старых польских говорах и в белорусских диалектах «брун» или «брунет» означало именно темный цвет, смуглость. Человек с такими внешними данными легко получал прозвище Брунец, Брунь, от которого и пошла фамилия.

Суффикс «-цкий» (а не «-ский» с твердым «с») — типичный для фамилий шляхетского или мещанского происхождения на землях бывшей Речи Посполитой. В Великом княжестве Литовском, куда входили современные Беларусь, часть Украины и Польши, суффикс «-цкий» закрепился за теми, кто владел землей или жил в определенном местечке. Но здесь, скорее всего, не топонимическая фамилия (от названия села Брунец), а прозвищная: Брунецкий — «сын или потомок Брунца». Модель образования простая: прозвище Брунец + суффикс принадлежности -цкий.

Встречается фамилия преимущественно в западных областях России, в Беларуси и на востоке Польши. В русских переписных книгах XVII–XVIII веков Брунецкие — это, как правило, однодворцы (потомки мелкой служилой шляхты) или мещане. В отличие от фамилий на «-ов/-ев», которые массово давали крестьянам после отмены крепостного права, Брунецкий — более старая и сословно окрашенная фамилия. Если предок носил её в XVIII веке, он, скорее всего, был не крепостным, а лично свободным человеком: шляхтичем, казаком или горожанином.

Есть и более редкая версия — от немецкого корня «Braun» (коричневый). В XVIII–XIX веках в Россию приезжали немецкие колонисты, и фамилию Брунецкий могли дать обрусевшему выходцу из Германии, адаптировав звучание. Но эта версия слабее: для немецких фамилий в русской среде типичнее суффикс «-ов» (Браунов), а не «-цкий». Поэтому основная и самая правдоподобная гипотеза — славянское прозвище по смуглости или темным волосам, закрепившееся в среде западнорусской мелкой шляхты.