Фамилия Бубновские — это вариант фамилии Бубновский, и её происхождение напрямую связано с прозвищем Бубен. В основе лежит не столько музыкальный инструмент, сколько целый веер значений, который вкладывали в это слово в разных говорах и социальных слоях. Самая очевидная версия — профессиональная: предок мог изготавливать бубны или играть на них, то есть быть скоморохом или музыкантом. Однако прозвище Бубен было неоднозначным. В народе говорили «гол, как бубен», называя так обнищавшего человека, у которого ничего за душой нет. В ярославских диалектах Бубном могли прозвать ленивого, не любящего работать человека. Наконец, от глагола «бубнить» — болтать без умолку — прозвище получали говорливые и не в меру болтливые люди. Таким образом, предок Бубновских мог быть и мастеровым, и бедняком, и пустословом.

Фамилия Бубновские сформировалась по модели, характерной для украинской и польской ономастики. Суффикс -ский (или -цкий) изначально указывал на принадлежность к местности или роду, но в случае с прозвищами он часто выполнял роль облагораживания простого имени, переводя его в разряд фамилий, звучащих по-шляхетски. Важно, что форма множественного числа — Бубновские — закрепилась в тех регионах, где было принято называть целый род или семью: «дом Бубновских», «семья Бубновских». Такая форма особенно распространена в Беларуси, на востоке Польши и в западных областях Украины. В отличие от фамилии Бубнов, которая могла появиться в великорусских землях, вариант с окончанием -ские указывает на более позднее формирование и более западные корни.

Точное время возникновения фамилии назвать сложно, но активное закрепление таких фамилий происходило в XVI–XVII веках, когда после Люблинской унии усилилось польское культурное влияние на украинских и белорусских землях. Именно тогда многие прозвища получили «шляхетское» оформление с суффиксом -ский.