Фамилия Бухрот — редкий пример немецкого по происхождению именования, которое в русском языке почти не изменило звучания. Её основа — два немецких корня: Buch («книга», «тетрадь в переплёте») и rot («красный», «алый»). Соединение этих слов даёт прозрачную, но не единственную версию значения.

Скорее всего, фамилия относилась к так называемым «профессиональным» прозвищам. Если исходить из буквального смысла, «Красная книга» могла указывать на человека, имевшего дело с книгами: типографа, переплётчика, писца или владельца книжной лавки. В средневековых немецких городах красный цвет часто использовался в вывесках и названиях мастерских, поэтому прозвище могло закрепиться за владельцем лавки с красной вывеской или за тем, кто работал с красными переплётами.

Однако есть и другая, более бытовая версия. В немецких диалектах Rotbuch могло быть прозвищем рыжеволосого человека (по аналогии с Rotkopf — «рыжая голова»). Первая часть Buch здесь может быть не книгой, а искажённым Buche («бук»), то есть «красный бук» — дерево с красноватой древесиной. Такое прозвище могли дать по цвету волос или по месту жительства у приметного дерева. Эта версия менее вероятна, потому что сочетание Buch в значении «книга» встречается в немецких фамилиях гораздо чаще, чем ботанические отсылки.

Фамилия образована без типичных русских суффиксов (-ов, -ин, -ский), что прямо указывает на её немецкие корни и позднее вхождение в русский язык. В Германии фамилия Buchroth встречается в землях Северный Рейн-Вестфалия и Нижняя Саксония, а в России носители Бухрот — это, как правило, потомки немецких колонистов, переселившихся в Поволжье или Причерноморье в XVIII–XIX веках. В метрических книгах лютеранских приходов фамилия могла записываться и как Бухротт, и как Бухрот.