Фамилия Бунбунова звучит необычно, но её происхождение прозрачнее, чем кажется на первый взгляд. Это женская форма фамилии Бунбунов, которая образована по стандартной русской модели с суффиксом -ов. Основа фамилии — прозвище или нецерковное имя Бунбун.

Ключ к разгадке лежит в тюркских языках. Слово «бун» (или «бунг») в ряде тюркских наречий означает «мятеж», «смута», «волнение». Удвоение корня (редупликация) — «бун-бун» — типичный для тюркской ономастики приём, который мог усиливать значение: «бунтарь», «неспокойный человек», «задира». Таким образом, Бунбуном на Руси могли прозвать человека с беспокойным, взрывным характером, возможно, участника какого-либо бунта или просто неуживчивого соседа.

Версия о происхождении от звукоподражания (например, «бум-бум» — подражание глухому удару или барабану) менее вероятна, хотя полностью исключать её нельзя: прозвища по звуку (Бах, Бом, Бунька) в крестьянской среде встречались. Однако для фамилии Бунбунов именно тюркская этимология выглядит предпочтительнее, так как объясняет и необычную форму корня, и его социальный оттенок.

Фамилия редкая. Её география, скорее всего, связана с регионами активного русско-тюркского пограничья: Поволжье, Приуралье, южные степи. В документах XVII–XVIII веков такие прозвища могли фиксироваться у служилых людей, казаков или крестьян, живших в зоне контакта с татарским, башкирским или ногайским населением. Сословный состав носителей фамилии, судя по всему, был крестьянским или мещанским — дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.