Фамилия Бушуйкина — женская форма фамилии Бушуйкин, и её происхождение напрямую связано с мужским прозвищем или неканоническим именем Бушуйка. Это типичная «бытовая» фамилия, образованная от прозвища, а не от крестильного имени.

Основа фамилии — глагол «бушевать» в его древнерусском значении «шуметь, буянить, вести себя неспокойно». Суффикс -к- в прозвище Бушуйка указывает на то, что так могли называть человека по характерному поведению: крикливого, задиристого, непоседливого. В русских говорах слово «бушуй» означало «буян», «озорник», а уменьшительная форма «бушуйка» могла относиться и к ребёнку, и к взрослому, которого в шутку или с укоризной называли «наш маленький буян».

Модель образования фамилии проста: прозвище Бушуйка + притяжательный суффикс -ин (чей? — Бушуйкин). Такая модель в XVI–XVII веках была распространена в центральных и северных русских землях, особенно среди крестьян и посадских людей. Суффикс -ин, а не -ов, указывает на то, что основа оканчивается на -а или -я, что типично для прозвищ с уменьшительным суффиксом.

Географически фамилия Бушуйкины встречается в основном в Поволжье и на Урале. В переписных книгах XVII–XVIII веков можно найти упоминания крестьян с таким прозвищем в Вятской и Пермской губерниях — регионах, куда активно переселялись люди из центральной России, и где прозвища часто закреплялись как фамилии. Это косвенно подтверждает, что предки Бушуйкиных были скорее всего свободными крестьянами или однодворцами, а не дворянами.

В отличие от фамилий, образованных от церковных имён (Иванов, Петров), Бушуйкина — яркий пример «мирского» именования, отражающего не святость, а житейскую черту. Сравните с однокоренными фамилиями: Буянов (от «буян»), Шумов (от «шум»), Шумилов (от «шуметь»). Все они — из того же гнезда «громких» прозвищ, и Бушуйкина среди них выделяется именно уменьшительным суффиксом, который смягчает смысл: не просто «буян», а «буянчик».