Фамилия Бушуйский — редкий случай, когда прозвище напрямую перешло в фамилию без промежуточного крестильного имени. В её основе лежит глагол «бушевать» или существительное «бушуй» — так в русских говорах называли буйного, шумного, неспокойного человека, забияку или драчуна. Модель образования проста: к основе «бушуй» добавили типичный для польской и западнорусской традиции суффикс -ский, который в XVI–XVII веках активно использовался для формирования фамилий у шляхты и духовенства. Однако в данном случае -ский, скорее всего, не указывает на дворянское происхождение, а служит для оформления фамилии по географическому принципу: Бушуйский — «выходец из мест, где жил или был известен некий Бушуй», либо «сын Бушуя».

Интересно, что фамилия Бушуйский почти не встречается в центральных и южных областях России. Основной ареал — север и северо-восток: Архангельская, Вологодская, Кировская области, а также Пермский край. Это косвенно подтверждает, что прозвище «бушуй» бытовало именно в северных говорах, где им могли наградить не только скандалиста, но и человека, работавшего на бурной реке или лесосплаве — в условиях, где «бушевать» было буквально необходимо.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Бушуев, Бушуйкин, Бушуй) показывает, что форма на -ский — самая поздняя и редкая. Она могла возникнуть в среде сельского духовенства: священнику с прозвищем Бушуй при поступлении в семинарию нередко давали фамилию Бушуйский, чтобы придать ей более книжное звучание. Впрочем, документальных подтверждений этой версии для Бушуйского нет — она остаётся правдоподобной гипотезой.

В дореволюционных метрических книгах фамилия встречается эпизодически, в основном среди крестьян и мещан северных губерний. Известных носителей, оставивших след в истории, не зафиксировано — фамилия осталась в тени, сохранившись в глухих деревнях и сёлах. Сегодня Бушуйский — один из тех редких антропонимов, который сразу выдаёт характер предка: не тихого и смирного, а того, кто «бушует».