Фамилия Бустанова — женская форма, а мужская, Бустанов, образована от прозвища или имени Бустан. В отличие от большинства русских фамилий на -ов, которые восходят к крестильным именам или названиям профессий, здесь мы имеем дело с корнем тюркского происхождения. Слово «бустан» (بستان) в персидском и тюркских языках означает «сад», «цветник», но чаще — не просто сад, а «райский сад», «цветущий край». Встречается это слово и в составе сложных восточных имён (например, Бустан-биби), и как самостоятельное мужское имя.

Вероятнее всего, фамилия Бустанов — это русифицированная форма тюркского имени Бустан, которое в русской среде оформилось по стандартной модели: к основе добавили патронимический суффикс -ов (чей? — Бустанов). Географически фамилия тяготеет к регионам, где исторически жили татары, башкиры, чуваши или другие тюркоязычные народы, — Поволжье, Приуралье, юг Сибири. Встречается она и у русских, но почти всегда указывает на предка, носившего восточное имя или прозвище, либо на смешанные браки.

Есть и другая версия, менее вероятная: от диалектного русского слова «бустан» — так в некоторых говорах называли бузину, кустарник. Тогда прозвище Бустан мог получить человек, живший в зарослях бузины или занимавшийся её сбором. Однако в русских говорах это слово редкое, а фамилия с таким корнем не фиксируется в центральных областях. Поэтому тюркское происхождение — основное.

Суффикс -ов указывает на то, что фамилия формировалась в среде, где преобладала модель «чей сын» или «чей человек». В сочетании с тюркским корнем это типичный пример адаптации восточного имени к русской фамильной системе, что происходило массово в XVI–XIX веках при взаимодействии с татарской знатью и крестьянами. Никаких сведений о дворянском происхождении или выдающихся носителях фамилии Бустанов/Бустанова в открытых источниках нет — это редкая, но устойчивая фамилия, сохранившая в себе память о восточном корне.