Фамилия Бустубаева — редкий пример тюркской фамилии с русским суффиксом, который почти не встречается в центральных регионах. Её основа — мужское имя Бустубай, а суффикс -ев (фонетический вариант -ов после мягких согласных) указывает на принадлежность: «сын Бустубая» или «из рода Бустубаевых». Такая модель типична для народов Поволжья, Урала и Сибири, где русская администрация в XIX веке адаптировала местные имена под стандартные фамильные окончания.

Имя Бустубай составное. Первая часть — «бусту» — восходит к тюркскому «буз» или «боз» (серый, светлый, иногда — крепкий, нерушимый). Вторая часть — «бай» — означает «богач», «хозяин», «господин». В дореволюционной кочевой среде бай — не столько про деньги, сколько про статус: владелец скота, уважаемый человек. Таким образом, Бустубай — это «крепкий хозяин» или «светлый господин». Имя давали с пожеланием мальчику стать надёжным, состоятельным главой рода.

Географически фамилия привязана к зоне расселения башкир и казахов. Наибольшая концентрация носителей — в Башкортостане и соседних областях (Оренбургская, Челябинская). Встречается она и у татар, но реже. В казахском варианте имя звучало бы как Бостабай, с той же семантикой, но с более отчётливым «о» в первом слоге.

Словообразовательная особенность фамилии — в суффиксе. В тюркских языках фамилии часто образуются прибавлением -ов/-ев или -ин, но «Бустубаева» хранит женскую форму окончания, что для справочных сайтов несущественно, а в быту указывает на происхождение от мужчины по отцу. В дореволюционных метрических книгах могла записываться как Бустобаев или Бустубаев — из-за неустойчивой передачи тюркских гласных кириллицей.

Сословие предков определить сложно: имя Бустубай не было дворянским или княжеским, но и не указывало на крепостную зависимость. Скорее всего, это были свободные скотоводы или земледельцы, получившие фамилию при первой переписи. Никаких широко известных исторических личностей с такой фамилией не зафиксировано — это фамилия народная, бытовая, без громкой родословной.