Фамилия Чалохьян — армянская по происхождению, что сразу видно по суффиксу -ян, самому распространённому фамильному показателю в Армении. Он заменял русское -ов/-ев и указывал на принадлежность к роду: «из дома такого-то». В диаспоре, особенно в среде армян, переселившихся в Российскую империю в XIX веке, окончание иногда писали через «ьян» или «янц», но Чалохьян — типичный вариант с сохранением армянской огласовки.

Основа фамилии — «чалох». В армянском языке слово «чалох» (ճալոխ) означает «головастик», «лягушонок» или, в переносном смысле, «недоросль», «малорослый человек». Это прозвище, скорее всего, дали либо за внешность (низкий рост, щуплое телосложение), либо за поведение — вертлявый, неусидчивый, как головастик. В армянской ономастике прозвища от названий животных и земноводных встречаются, хотя и реже, чем от профессий или имён. Версия, что «чалох» могло быть диалектным вариантом другого слова или искажённым тюркским заимствованием, маловероятна: корень чистый, армянский.

Географически фамилия тяготеет к западным областям исторической Армении, откуда в конце XIX — начале XX века шла массовая эмиграция. Чалохьяны встречаются среди потомков выходцев из Вана, Эрзурума и окрестностей озера Ван. После геноцида армян 1915 года многие носители фамилии оказались в Краснодарском крае, Ростовской области и в странах Ближнего Востока. В современной России Чалохьян — редкая фамилия, не входящая даже в первую тысячу по частотности.

Словообразовательная модель проста: корень «чалох» + суффикс принадлежности -ян. Никаких дополнительных приставок или усложнений нет. Фамилия недвусмысленно говорит о том, что предок носителя был человеком с прозвищем Чалох, то есть «Головастик» или «Малыш». В армянской традиции такие прозвища не считались обидными — они фиксировали яркую, запоминающуюся черту, которая закреплялась за родом на поколения. Сословной привязки у фамилии нет: «чалохом» могли назвать и крестьянина, и ремесленника, и даже священника, если тот был низкорослым.