Фамилия Чапушин образована по одной из самых распространённых в русской ономастике моделей — с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Чапушин, то есть сын или потомок Чапуши. Основа здесь — прозвище Чапуша. Слово «чапа» или «чапуша» в русских говорах означало нечто размокшее, разбухшее, а также неопрятного, неряшливого человека. В. И. Даль в своём словаре фиксирует глагол «чапать» — хватать, брать, а «чапуша» — это тот, кто возится с мокрым, грязным делом. Так могли прозвать человека, который работал с водой или глиной, либо просто неряшливого по характеру.

Есть и вторая, менее очевидная версия. В некоторых регионах «чапать» означало ковылять, идти вперевалку. Тогда Чапуша — прозвище человека с характерной походкой. Оба варианта лежат в бытовой, нецерковной сфере: фамилия явно не из календарных имён, а из прозвищной среды.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России. Чапушины встречаются в Вологодской, Архангельской губерниях, а также на Урале. Там, где много воды и болот, слово «чапа» было в ходу. Суффикс -ин типичен для фамилий, образованных от основ на -а, -я, что подтверждает разговорное происхождение.

Сословный состав носителей — в основном крестьяне и мещане. В документах XIX века Чапушины числятся среди государственных крестьян, реже — среди купцов. Дворянских корней у фамилии не прослеживается: это типичная «народная» фамилия, возникшая из уличного прозвища, а не из поместного землевладения.

Интересно, что фамилия Чапушин стоит в ряду однокоренных: Чапаев, Чаплин (не путать с Чарли), Чапурин. Все они восходят к одному корню «чап-» с разными суффиксами. Но если Чапаев широко известен благодаря комдиву, то Чапушин остался в тени — редкая, локальная фамилия, сохранившая бытовое прозвище предка.