Фамилия Ченицына — женская форма фамилии Ченицын. Чтобы понять её происхождение, нужно разобрать мужской вариант, который образован по классической модели: основа плюс суффикс -ин, указывающий на принадлежность. В русских фамилиях -ин характерен для основ, оканчивающихся на -а или -я. Здесь основа — Ченица.

Что такое Ченица? Это прозвище или уменьшительная форма от нецерковного имени. Самый прямой путь — от слова «ченица», которое в северных русских говорах (архангельских, вологодских) означало «черемуха». Ягоду называли «ченица», «ченика» или «череница». Тогда Ченица — человек, живший у зарослей черемухи, либо получивший прозвище по цвету волос или глаз (в цвет черемухи), либо собиравший эту ягоду.

Вторая версия, менее очевидная, но тоже возможная: Ченица — это искаженное «ченица» от «чен» (чин, порядок) или вариант фамилии Чиницына, связанной с птицей синицей. Однако для фамилии Ченицына первая версия с черемухой правдоподобнее: она объясняет редкую основу и имеет конкретную диалектную подоплеку.

Суффикс -ин в фамилии Ченицын не оставляет сомнений в том, что перед нами отчество второго порядка: Ченицын — сын Ченицы. Такая модель была массовой в XVI–XVII веках в среде крестьян и посадских людей. Фамилия, скорее всего, оформилась в северных и центральных губерниях России, где слово «ченица» было в ходу. Сословно — крестьянская или мещанская: дворянские роды с таким окончанием — редкость, и фамилия Ченицыных в родословных книгах не значится.

В написании Ченицына с буквой «ы» после «ц» — это исторически верная орфография, закрепившаяся в документах до реформы 1918 года. Встречаются варианты Ченицина (с «и»), но они поздние и чаще результат ошибки писаря.