Чепукавичус — это балтийский вариант славянской фамилии Чепукович. Возможно, она образована от топонима Чепуки: местечко с таким названием есть в Белоруссии, в Миорском районе Витебской области. Следовательно, основатель рода Чепукавичус мог быть выходцем из этого населенного пункта. Однако в основе этой фамилии может лежать прозвище Чепук, которое ведет свое начало от украинского нарицательного «чепа» - «предмет на дне водоема, за который может зацепиться удочка или рыбачья сеть». Вероятно, это прозвище содержало указание либо на род деятельности основателя фамилии (рыбак), либо на особенности характера и поведение предка (цепкость, деловитость, оборотистость). В русском языке существовал однокоренной глагол «чепать» - «подцеплять», «цеплять».