Фамилия Череникина — женская форма фамилии Череникин, а та, в свою очередь, образована от прозвища или мирского имени Череника. Основа здесь — слово «череника» (или «черника»), ягода, широко известная в северных и центральных регионах России. Однако связь с ягодой не единственная и, возможно, не главная.

Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: Череникин буквально означал «сын Череники» или «человек из рода Череники». Такие фамилии типичны для северных и центральных губерний России, где модель на «-ин» конкурировала с общераспространённым «-ов». Само прозвище Череника могли дать по двум разным причинам. Первая, самая очевидная: человек, собиравший или торговавший черникой, либо имевший смуглый, «ягодный» цвет лица. Вторая, менее известная, но не менее вероятная: в диалектах «череника» могла означать не только ягоду, но и черенок — рукоятку инструмента, или даже черен (в значении «череп»). В таком случае прозвище относилось к ремесленнику, делавшему черенки для ножей, лопат, кос, или к человеку с характерной формой головы.

Интересная деталь: фамилия Череникин, а следовательно, и Череникина, встречается в основном в Поволжье и на Урале, особенно в Пермском крае и Кировской области. Это зона, где активно бытовали диалектные слова, не дошедшие до литературного языка. Поэтому версия с «черенком» (рукояткой) для этих мест даже правдоподобнее «ягодной»: плотницкое и кузнечное дело было распространено шире, чем массовый сбор ягод на продажу.

Словообразовательная структура проста, но без дополнительного контекста (знания местного говора) точное значение ускользает. Сословно фамилия, скорее всего, крестьянская или мещанская — такие «именные» фамилии на «-ин» редко встречались у дворянства, которое предпочитало формы на «-ский».