Фамилия Черковер — одна из тех, что сразу выдают географическое происхождение носителя. Её основа — топоним, а суффикс -ер указывает на принадлежность к месту, что характерно для фамилий еврейского населения Восточной Европы. Если разобрать слово: корень «Черков» почти наверняка отсылает к названию города Черков (или Чарков), который находился на территории современной Украины или Польши. Вторая часть, -ер, в данном случае — формант, означающий «житель» или «выходец из». Таким образом, Черковер — это «тот, кто из Черкова».

Вероятнее всего, фамилия возникла как прозвище или идентификатор для человека, переселившегося из этого местечка в другой город. В среде ашкеназских евреев такие фамилии были особенно распространены в конце XVIII — начале XIX века, когда после указов о всеобщей регистрации населения многие получили фамилии по месту рождения или проживания. Конкретный населённый пункт Черков мог быть небольшим штетлом, и следы его можно искать в Волынской или Подольской губерниях — регионах с плотным еврейским населением.

Спорных версий у этой фамилии немного. Иногда её пытаются связать со славянским словом «черков» (церковь), но это маловероятно: суффикс -ер не типичен для славянской модели образования фамилий (там скорее встречались бы Черковский или Черков). Если бы основа была славянской, фамилия звучала бы иначе. Поэтому лингвистически версия с топонимом и ашкеназским суффиксом — единственная убедительная.

Носители фамилии Черковер встречаются в основном среди потомков еврейских эмигрантов из Российской империи, расселившихся в США, Израиле и странах Европы. В дореволюционных записях фамилия фиксируется в метрических книгах еврейских общин Подолии и Волыни. Известных исторических деятелей с этой фамилией нет в широком доступе, что типично для фамилий, образованных от малых местечек — их носители были ремесленниками, торговцами или мелкими лавочниками.