Фамилия Чернодубровская — редкий пример, где топонимическая основа не потеряла прозрачности спустя столетия. В отличие от большинства фамилий на -ский, которые уже не отсылают к конкретному месту, эта прямо указывает на географический объект: Чёрная Дуброва или Чёрная Дубровка. «Дуброва» в славянских говорах — не роща, а именно дубрава, лиственный лес с преобладанием дуба. Определение «чёрная» в топонимике обычно означало либо тёмный, густой лес, либо лес на чёрной, нечернозёмной почве, либо просто более старый массив по сравнению с соседними.

Словообразовательная модель здесь классическая для дворянских и духовных фамилий XIX века: основа топонима плюс суффикс -ск- и окончание -ая/-ий. Такие фамилии давались по названию имения, деревни или города, которым владел род, или по месту рождения. В случае Чернодубровской, скорее всего, предок получил фамилию от названия небольшого поселения — Чёрная Дуброва. Такие названия встречаются в Беларуси, на Украине и в западных областях России, что указывает на западное или юго-западное происхождение рода.

Интересная деталь: в фамилии сохранилась полная, а не усечённая форма прилагательного — «Чернодубровская», а не «Чернодубровская» (хотя вариант без окончания -ая тоже возможен у мужчин). Это типично для фамилий, которые закрепились в женском роде как «Чернодубровская», а в мужском — «Чернодубровский». Такая пара указывает на то, что фамилия не прошла стадию упрощения в крестьянской среде, где чаще отсекали окончание, а осталась в книжной, официальной форме.

Встречается фамилия преимущественно в среде потомков мелкопоместного дворянства или духовенства. Духовные училища и семинарии часто давали будущим священникам фамилии по названиям их родных сёл и деревень, причём в полной, «красивой» форме. Поэтому Чернодубровский мог быть выпускником семинарии, которому дали фамилию по месту рождения — селу Чёрная Дуброва. В дворянском варианте фамилия могла возникнуть, если род владел усадьбой с таким названием. Спор между этими версиями решается только по конкретной генеалогии, но лингвистически фамилия бесспорно топонимическая и довольно поздняя — не старше XVIII века.