Фамилия Черношкуренко — украинская по происхождению, что ясно по суффиксу -енко, который в XVI–XVII веках закрепился в Поднепровье как основной патронимический формант. Он указывал на сына или потомка человека, названного в основе: Черношкуренко — «сын Черношкура».

Основа Черношкур — прозвище, которое складывается из двух корней: «черн-» (чёрный) и «шкур-» (шкура, кожа). В прямом смысле так могли прозвать человека со смуглой, тёмной кожей, либо того, кто работал с чёрными дублёными шкурами — кожевника или скорняка. В украинских говорах «шкура» нередко обозначала и внешность, и характер: «чёрная шкура» могло быть грубоватым, но не обязательно обидным прозвищем для человека коренастого, тёмноволосого или смуглого.

В отличие от великорусских фамилий на -ов/-ев, которые часто закрепляли прозвище за целым родом, украинская модель на -енко изначально была более подвижной: она обозначала конкретного сына. Однако к XIX веку, после переписи населения Российской империи, такие фамилии стали наследственными. Черношкуренко — редкий пример, где основа не усечена и не русифицирована: сохранилось полное прозвище «Черношкур», а не «Черношкуров» или «Черношкурин».

Географически фамилия тяготеет к левобережной Украине — Черниговщине, Полтавщине, Слобожанщине. Встречается она редко: по открытым данным, на всю Украину приходится не более нескольких десятков носителей. Это говорит о том, что родоначальник был локально известен, но фамилия не разошлась широко, что типично для прозвищ, образованных от внешних признаков, — они реже давали начало массовым фамилиям, чем прозвища по профессии.

В русском написании фамилия сохранила украинскую фонетику: «Черношкуренко», а не «Черношкуренко» с ударением на первый слог (в украинском ударение падает на «у» — Черношку́ренко). Встречаются варианты Черношкуренко и даже Черношкурэнко, но нормативным считается первый.

Таким образом, Черношкуренко — это фамилия-характеристика, которая прямо говорит о внешности или роде занятий предка. Она не связана с дворянством или казацкой старшиной, а скорее принадлежала крестьянской или ремесленной среде. Если вы носите эту фамилию, ваш предок, скорее всего, был человеком с тёмной кожей или кожевником из украинского села, чьё прозвище закрепилось за потомками в форме, типичной для малороссийской ономастики.