Фамилия Черняченко — яркий пример украинской модели фамилий на -енко. Этот суффикс, самый популярный в украинской антропонимии, изначально означал «сын» или «потомок». То есть Черняченко — это буквально «сын Черняка». Такие фамилии закрепились в Поднепровье, на Слобожанщине и Левобережной Украине в XVI–XVII веках, когда патронимическая модель вытеснила прозвища и отчества.

В основе фамилии лежит прозвище Черняк. Его давали человеку с очень тёмными волосами или смуглой кожей — «чернявому». В славянской традиции внешние признаки были одним из главных источников прозвищ, поэтому Черняк — не редкость. От него пошли и другие фамилии: Черняев, Черняков, Чернявский. Но Черняченко стоит особняком: суффикс -енко не просто указывает на родство, а подчёркивает, что носитель — потомок конкретного Черняка, а не просто «чернявый человек».

У этой фамилии есть любопытная особенность: она могла возникнуть и в русских южных регионах, граничащих с Украиной (Курская, Воронежская, Белгородская области). В XVI–XVII веках туда переселялись украинские казаки и крестьяне, принося с собой свою фамильную модель. Поэтому Черняченко встречается не только на Украине, но и на юге России, причём часто с ударением на второй слог — Черняче́нко, что характерно для украинского произношения.

Сословного барьера у фамилии не было. Черняченко могли быть и казаками, и крестьянами, и мещанами. В реестрах Запорожского войска встречаются казаки с такой фамилией, но это не значит, что все носители — потомки казаков. Фамилия просто указывает на то, что предка звали Черняк, а дальше — как сложилась судьба рода.