Фамилия Чесаченко — характерный пример украинской модели фамилий на -енко, которая в XVII–XVIII веках стала самой массовой на Левобережной и Слободской Украине. Суффикс -енко означал «сын», «потомок» или «ученик», а иногда и «помощник» того, кто назван в корне. Поэтому Чесаченко — это буквально «сын Чесака» или «потомок человека по прозвищу Чесак».

Корень здесь — чес-, который прямо отсылает к глаголу «чесать». В украинском языке слово «чес» могло означать чесотку, а «чесати» — скрести, царапать. Однако прозвище Чесак вряд ли давали за кожную болезнь: скорее, его получал человек, который постоянно чесал затылок в задумчивости, или тот, кто занимался чесанием льна и конопли — важнейшим ремеслом в крестьянском хозяйстве. В русских говорах «чесать» имело и переносное значение: «говорить бойко, без умолку»; Чесаком могли прозвать болтуна или задиру.

Суффикс -ак в основе Чесаченко (Чесак → Чесаченко) типичен для украинских и южнорусских прозвищ: он придавал слову оттенок характерности или профессии. Сравните: «стригун» — «стригач», «скалозуб» — «скалозубач». Чесак — тот, кто чешет (лён, шерсть или языком).

Географически фамилия Чесаченко чаще всего встречается в Черниговской, Полтавской и Сумской областях Украины, а также в приграничных районах России (Белгородская, Курская области). В XIX веке носители фамилии относились к казацкому сословию или государственным крестьянам — никаких дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

В написании фамилии возможен вариант Чисаченко (через «и»), но он редок и связан с местным аканьем или ошибочной записью в метриках. Основная форма — Чесаченко — устойчива и однозначно указывает на украинское происхождение предков, занимавшихся ремеслом или получивших прозвище за манеру поведения.