Фамилия Чесюлис — редкий пример, когда географическое происхождение почти наверняка перевешивает этимологическую загадку. Судя по суффиксу, это типичная литовская или жемайтская фамилия на -ис (-is), которая в русской записи получила окончание -ис вместо стандартного литовского -is. В Литве такие фамилии массово русифицировали в XIX веке, но корень остался узнаваемым.

Разбор основы сложнее. Прямого соответствия в литовском языке «česulis» нет. Наиболее вероятная версия — отглагольное происхождение от литовского češti или češti (чесать, расчёсывать). В таком случае Чесюлис — прозвище человека с определённой профессией: чесальщик льна или шерсти. В доиндустриальной Литве обработка льна была домашним промыслом, и специалист по чесанию мог получить устойчивое прозвище, которое потом закрепилось как фамилия.

Менее убедительна, но возможна версия от личного имени. В польском и белорусском пограничье встречается имя Чеслав, уменьшительная форма — Чесюк или Чесюля. Фамилия Чесюлис могла образоваться от такой формы по литовской модели: Чесюля + -ис, то есть «сын Чесюли». Однако для литовской ономастики характернее патронимы на -айтис или -унас, а форма на -ис чаще указывает на прозвище, а не на отчество.

Географически фамилия тяготеет к северо-востоку Литвы и приграничным районам Латгалии. В современных литовских справочниках она встречается единично, что подтверждает её редкость. Носители фамилии, скорее всего, происходят из крестьянской среды — мелких землевладельцев или ремесленников, которые после отмены крепостного права в XIX веке получили официальную фамилию именно в такой русифицированной записи.

Однокоренных фамилий в русском или белорусском контексте практически нет: Чесюлис стоит особняком, не смешиваясь с распространёнными Чесноковыми или Чесновыми. Это дополнительно подтверждает его узкое региональное бытование.