Фамилия Чиржонкова — женская форма фамилии Чиржонков, а та, в свою очередь, образована от прозвища или имени Чиржонок. Это редкая модель, указывающая на то, что перед нами потомок человека с прозвищем на -онок/-ёнок. Такие фамилии типичны для северных и центральных областей России, где суффикс -онок/-ёнок означал не просто уменьшительность, а «сын» или «детёныш»: Чиржонок — буквально «маленький Чирж» или «сын Чиржа».

Основа «Чирж» — наиболее интересная часть. В русских говорах слово «чирж» (или «чиржак») могло обозначать чирка, то есть мелкую водоплавающую птицу из рода уток. Прозвище Чирж могли дать невысокому, юркому человеку, либо тому, кто охотился на эту птицу или держал её. Однако есть и альтернативная версия: в некоторых диалектах «чирж» — это вариант слова «чиж» (птица), который мог звучать с местным «оканьем» или цоканьем. Тогда прозвище относилось к щеголеватому, подвижному человеку.

Географически фамилия Чиржонкова — редкая, её корни скорее всего лежат в Псковской, Новгородской или Тверской области, где суффикс -онок и диалектное «чирж» встречаются чаще. В писцовых книгах XVI–XVII веков фамилия не зафиксирована, что подтверждает её позднее, крестьянское происхождение: такие «полуфамилии» на -онок часто закреплялись за семьями в XVIII–XIX веках, когда крестьяне получали устойчивые родовые прозвания.

Спор о том, от птицы или от человеческого имени образована основа, решается в пользу прозвища: в русской ономастике почти нет имён Чирж, зато прозвища по птицам — Чиж, Чирик, Чирка — широко известны. Таким образом, Чиржонкова — это фамилия, которая говорит о предке-«чирке», вероятно, невысоком и быстром, и сохраняет редкую северорусскую словообразовательную модель.