Фамилия Чизганов — редкая и неочевидная для разбора. Чтобы понять её происхождение, стоит начать с финала. Суффикс -ов указывает на типичную русскую патронимическую модель: Чизганов — сын Чизгана. Значит, в основе лежит личное прозвище или неканоническое имя Чизган.

Самое интересное — корень «чизг-». Он не встречается в распространённых русских словах. Вероятнее всего, это искажённое или диалектное звучание тюркского слова. В языках Поволжья и Приуралья (татарском, башкирском, чувашском) есть основа «чыз» или «чиз» со значением «царапина», «рубец», «черта». Суффикс -ган в тюркских языках образует причастия или имена деятеля. Таким образом, Чизган могло означать «тот, кто делает царапины» или «меченый рубцом» — прозвище, данное по внешней примете или роду занятий (например, резчик по дереву, кости).

Вторая версия, менее вероятная, связывает фамилию с русским диалектным глаголом «чизгать» — резать, сечь, хлестать. В некоторых говорах так называли небрежную стрижку или рубку. Тогда Чизган — человек, который «чизгает», то есть работает грубо, наскоро, возможно, плотник или мясник. Однако в письменных источниках этот глагол фиксируется редко, что делает тюркскую гипотезу предпочтительнее.

Фамилия Чизганов практически не встречается в центральных областях России. Её ареал, по данным открытых источников, тяготеет к Уралу и Западной Сибири, что косвенно подтверждает связь с тюркским субстратом. Носители фамилии — потомки человека по прозвищу Чизган, который мог быть выходцем из татарской или башкирской среды, принявшим православие, либо русским, получившим прозвище от соседей-тюрков. В любом случае, фамилия сохранила след межэтнического контакта, типичного для истории русского пограничья.