Фамилия Чизухина — женская форма фамилии Чизухин, и её разбор сразу упирается в редкую и неочевидную основу. Сама фамилия крайне нетипична для русского ономастикона: в ней нет привычных корней, связанных с профессиями, животными или распространёнными личными именами. Словообразовательная модель проста: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), то есть Чизухин — это «сын Чизухи» или «человек из рода Чизухи». Но вот что такое «Чизуха» — главный вопрос.

Наиболее правдоподобная версия связывает основу с диалектным или искажённым прозвищем. В говорах русского Севера и Урала фиксировалось слово «чиз» или «чиза» — так могли называть человека с необычной походкой, прихрамывающего или семенящего. Суффикс -ух(а) в русских прозвищах типичен для характеристики по внешнему признаку или поведению (сравните: «горбуха», «кривуха», «толстуха»). Таким образом, Чизуха — прозвище человека с характерной манерой ходить, а фамилия Чизухин закрепилась за его потомками.

Менее вероятная, но не исключённая версия — связь с тюркскими корнями. В татарском и башкирском языках есть слово «чиш» (родник, источник) или «чизе» (черта, граница). Однако переход «ч» в «ц» и суффикс -ухин для тюркских заимствований нетипичны, поэтому эта гипотеза слабее. Географически фамилия Чизухина встречается точечно, в основном в центральных областях России и в Поволжье, что не противоречит севернорусскому диалектному происхождению — носители могли мигрировать в более поздние века.

Социальный контекст: суффикс -ин характерен для фамилий, образованных от прозвищ и имён в крестьянской и мещанской среде. Чизухины, скорее всего, были не дворянского рода, а людьми из податных сословий — крестьянами или посадскими. Фамилия не имеет вариантов написания с «а» на конце в мужской форме (Чизухин, а не Чизухинский), что дополнительно указывает на её бытовое, а не искусственное происхождение. Сегодня Чизухина — редкая фамилия, и её носители, заглядывая в прошлое, могут с высокой долей уверенности считать, что их предок носил прозвище, данное за походку или манеру двигаться.