Фамилия Чодонова — женская форма фамилии Чодонов. Её происхождение неочевидно, и чтобы разобраться, нужно отбросить привычную русскую модель и присмотреться к корню. Суффикс -ов(-а) указывает на принадлежность («чей?»), но сама основа «Чодон» для русского уха звучит чужеродно. Скорее всего, перед нами фамилия, возникшая на стыке тюркских и монгольских языков, где слово «чодон» или близкие к нему формы могли означать что-то вроде «сильный», «выносливый» или быть прозвищем, связанным с родом занятий.

Вероятнее всего, фамилия имеет бурятские или калмыцкие корни. В бурятском языке есть слово «содон» — «редкий», «отборный», но с учётом диалектных особенностей возможен переход «с» в «ч» (явление, известное в некоторых тюркских и монгольских говорах). Тогда Чодонов — потомок человека по прозвищу Чодон, то есть «редкостный», «особенный». Вторая, более прозаичная версия: «чодон» могло быть вариантом слова «чодор» — узда или часть конской сбруи. В таком случае прозвище мог получить конюх, шорник или тот, кто держал лошадей.

Фамилия редкая, её географический ареал сегодня тяготеет к Забайкалью и Бурятии, что подтверждает её региональное происхождение. Встречается она и среди сибирских татар, но там основа могла исказиться иначе. В отличие от распространённых русских фамилий на -ов, где основа — крестильное имя или профессия, здесь мы имеем дело с адаптацией иноязычного прозвища, которое в русской среде оформилось по стандартной модели принадлежности.

Сословно предки Чодоновых, скорее всего, относились к бурятским казакам или крестьянам-скотоводам. Дворянских родов с такой фамилией нет, что тоже косвенно указывает на её народное, а не книжное происхождение. Фамилия не попала в дореволюционные справочники, но встречается в метрических книгах Восточной Сибири начала XX века.