Фамилия Чоджан — редкий пример, где вопрос происхождения упирается не в суффикс, а в корень. В русской ономастике нет устоявшейся модели, которая объяснила бы её через славянские прозвища или имена. Скорее всего, перед нами фамилия, пришедшая из другого языка, и её разбор требует этнической привязки.

Самый вероятный источник — тюркские или кавказские языки. В тюркском «чоджан» может быть вариантом имени или прозвища от корня «чод» (в некоторых диалектах — «обильный», «полный») с уменьшительным суффиксом «-ан». Встречается также форма «Чожан» у народов Дагестана, где «чо» может означать «место» или «селение», а «жан» — «душа» (из персидского). В таком случае фамилия могла значить «душа селения» или «местный житель», что типично для прозвищ, перешедших в фамилии.

Вторая версия — армянские корни. В армянском «чоджан» (Չոջան) нередко связывают с диалектным словом «чодж» — «большой», «старший». Если так, фамилия могла указывать на уважаемого человека, старейшину рода. Суффикс «-ан» в армянских фамилиях — стандартный патронимический показатель (как «-ян»), так что Чоджан могло означать «из рода Чодж» или «потомок старшего».

Третья, более экзотическая гипотеза — индийское происхождение. В пенджаби и синдхи «чоджан» (चौजन) — это «четыре души» или «четверо», иногда как прозвище для четвертого ребенка. Но для русского контекста эта версия маловероятна: фамилия не фиксируется в исторических документах как результат миграции из Индии.

По географии бытования: в России фамилия Чоджан встречается единично, в основном на юге — в Краснодарском крае, Ставрополье, а также в Москве. Это подтверждает её связь с Кавказом или Закавказьем, откуда носители могли переселиться в советское время. В армянской диаспоре фамилия Чоджан (в написании Չոջան) встречается чаще, особенно в Ереване и Гюмри.

С точки зрения словообразования фамилия не имеет привычных русских суффиксов (-ов, -ин, -ский), поэтому её носители — почти наверняка потомки людей, получивших фамилию не по отчеству, а по прозвищу или родовому имени в среде, где патронимическая модель была иной. Если ваш предок носил фамилию Чоджан, скорее всего, он происходил из армянской, тюркской или дагестанской среды, а сама фамилия указывала либо на старшинство, либо на место жительства.