Фамилия Чоконарь — редкий случай, когда происхождение можно установить почти точно, и оно связано с конкретным ремеслом. В основе фамилии лежит молдавское слово «чокан» (ciocan), что переводится как «молот» или «молоток». Соответственно, «чоконарь» — это мастер, работающий молотом: кузнец, молотобоец, а в более широком смысле — любой ремесленник, занятый ковкой или обработкой металла ударным инструментом.

Фамилия образована по типичной для восточнороманских языков модели: основа (чокон-) + суффикс деятеля (-арь). В русском языке она сохранила молдавское окончание, не получив типичных славянских суффиксов -ов или -ин. Это указывает на то, что фамилия сложилась в среде, где молдавский язык был основным, и лишь позже была записана в русскоязычных документах.

Географически фамилия Чоконарь почти наверняка привязана к историческим землям Бессарабии, Молдавии и соседним областям Украины (Одесчина, Черновицкая область). В центральной России она встречается редко, и если попадается — это, скорее всего, следствие переселения или миграции XX века.

В отличие от многих русских фамилий, где ремесленные прозвища со временем становились фамилиями через отчество (сын кузнеца — Кузнецов), Чоконарь закрепилась как прямая профессиональная характеристика. Предок носителя этой фамилии был не просто владельцем кузницы, а именно работником у горна и наковальни — «чоконарём». Это прозвище могло закрепиться за ним в общине, а затем передаться детям уже как фамилия, без добавления суффиксов принадлежности.

Встречаются варианты написания — Чоконар, Чоконаров (последний — результат русификации). Но именно форма Чоконарь — самая архаичная и точная, сохранившая прямой след молдавского произношения.