Фамилия Чорноштан — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, сохранилось почти без изменений и сразу читается. Это украинская или южнорусская фамилия, образованная по продуктивной модели сложения двух основ: «чорно-» (чёрный) и «-штан» (штаны, порты). В прямом смысле — «Чёрные штаны». Такие составные прозвища давали по самой заметной детали внешности или одежды: человек постоянно носил тёмные порты, либо это была его отличительная черта в быту.

Суффикса в фамилии нет — она бессуффиксная, что типично для украинских прозвищных фамилий (сравните: Білоус, Кривонос, Сухобрус). В русской традиции такое прозвище чаще получило бы суффикс -ов (Чорноштанов), но украинская модель оставила форму без наращения, закрепив её как неизменяемую. Ударение, скорее всего, падает на последний слог: Чорношта́н.

Корень «штан» — старорусское и украинское обозначение штанов, портов. В говорах слово «штаны» закрепилось поздно, а в XVI–XVII веках говорили «штан» (единственное число) или «штаны». Прозвище Чорноштан могло быть не только бытовым, но и ироничным: в среде казаков или крестьян тёмные штаны из грубого домотканого сукна были обычной одеждой, так что прозвище могло даваться «для отличия» в многолюдной общине, где все ходили в похожем.

Географически фамилия тяготеет к Черкасской, Полтавской и Киевской областям Украины, а также к югу России (Кубань, Ростовская область) — туда переселялись украинские крестьяне и казаки. Встречаемость очень низкая, фамилия не входит в списки распространённых. В дореволюционных метрических книгах она фиксируется в написании «Чорноштан» и «Черноштан» — второй вариант результат адаптации к русской орфографии, где «чёрный» писали через «е».

О сословной принадлежности носителей судить сложно из-за малочисленности, но прозвищная основа указывает на крестьянскую или казацкую среду: фамилии по предметам одежды редко встречались у дворянства. Родственных фамилий — Чорноштанов, Черноштанов, Черноштан — тоже немного, и все они генетически связаны с тем же прозвищем.