Фамилия Чойбсонов — редкий случай в русском ономастиконе. Её основа и ареал указывают на бурятское или монгольское происхождение. Скорее всего, перед нами русифицированная форма бурятской фамилии, образованной от личного имени Чойбсон.

Разбираем по частям. Имя Чойбсон (варианты: Чойбсон, Чойбсан) восходит к тибетскому «чой» (дхарма, учение) и «бсон» (защита, сохранение). В буддийской традиции, распространённой среди бурят и калмыков, такие имена давали с пожеланием защиты веры или под влиянием ламаистских текстов. Суффикс «-ов» — типичный русский патронимический суффикс, который добавили при переходе фамилии в русскоязычную среду, например, при записи в метрические книги или советские документы.

Интересная деталь: фамилия Чойбсонов почти не встречается за пределами Бурятии и соседних регионов (Иркутская область, Забайкалье). Это говорит о том, что её носители — потомки бурят, которые получили фамилию в XIX — начале XX века, когда царская администрация массово «обрусевала» инородческие имена. В отличие от фамилий на «-ев» или «-ин», здесь суффикс «-ов» присоединён к основе, оканчивающейся на твёрдый согласный («н»), что грамматически верно, но для бурятского уха звучит непривычно.

Если копнуть глубже, можно предположить, что родоначальник Чойбсоновых мог быть ламой или человеком, тесно связанным с буддийским духовенством. Однако это лишь гипотеза: имя Чойбсон давали и мирянам. Прямых аналогов в других языках нет — это не славянская и не тюркская фамилия, а узкорегиональная, сохранившая связь с тибето-монгольским культурным слоем.