Фамилия Чубоксаров — редкий случай, когда географическая привязка почти очевидна, но не единственна. Основа фамилии — «Чубоксар» — напрямую отсылает к названию города Чебоксары, столицы Чувашии. Однако в написании есть особенность: вместо привычного «Че-» стоит «Чу-». Это не ошибка, а отражение старого или диалектного произношения: до реформы орфографии и унификации названий вариант «Чубоксары» (или «Чубакасы») встречался в документах XVII–XVIII веков. Так фамилия законсервировала живую народную речь, какой её слышали приезжие или переписчики.

Суффикс «-ов» указывает на стандартную русскую модель образования: «Чубоксар» + «-ов» = «сын Чубоксара». То есть фамилия могла означать «выходец из Чебоксар» или «тот, кто связан с этим городом». В русской ономастике такие топонимические фамилии давали переселенцам: человек, переехавший в другую местность, получал прозвище по прежнему месту жительства. Например, крестьянин из-под Чебоксар, осевший в Нижегородской или Вятской губернии, для соседей становился «Чубоксаром», а его дети — Чубоксаровыми.

Версия с чувашским корнем «чубо-» (от «чăваш» — чуваш) тоже возможна, но менее вероятна: суффикс «-сар» нехарактерен для тюркских языков в роли фамильного окончания. Скорее всего, перед нами чисто русское образование от искажённого названия города, закрепившееся в устной традиции. Подобные примеры — Казаков (от Казань), Москвин, Рязанов — работают по тому же принципу.

Встречаемость фамилии крайне низкая. По открытым данным, основная масса носителей живёт в Поволжье — в Чувашии, Татарстане, Нижегородской области. Это логично: именно там потомки переселенцев из Чебоксар могли сохранить фамилию в локальных записях метрических книг. В дворянских родословных Чубоксаровы не значатся — фамилия крестьянская или мещанская, без сословных привилегий.

С точки зрения словообразования интересен переход «Че-» в «Чу-». Он мог возникнуть под влиянием чувашского произношения: в чувашском языке звук «е» в начале слова часто редуцируется или меняется на «у» (сравните «Чебоксары» и чувашское «Шупашкар»). Русские переселенцы, слыша местное произношение, могли записать его на слух как «Чубоксары», и эта форма закрепилась в прозвище. Таким образом, фамилия Чубоксаров — не просто указание на географию, а фонетический снимок русского-чувашского языкового контакта XVIII века.