Фамилия Чудутов — редкая и морфологически прозрачная, но с неочевидной основой. Она образована по стандартной русской модели с суффиксом -ов, который указывает на принадлежность: Чудут — сын или потомок человека по прозвищу или имени Чудут. Вопрос упирается в то, что такое «чудут» и откуда оно взялось.

Самый прямой путь — разобрать слово как диалектное или искажённое. В русских говорах встречается глагол «чудить» (вести себя странно) и существительное «чудо». Но суффикс -ут в основе «Чудут» нехарактерен для исконно русских прозвищ. Он скорее напоминает тюркские или монгольские антропонимы, где -ут — распространённый аффикс множественности или принадлежности (ср. «улус», «ногай»). Возможно, фамилия восходит к прозвищу Чудут, которое дали человеку из тюркоязычной среды или связанному с кочевыми народами. В таком случае корень может соотноситься с тюркским «чут» (слух, молва) или «чуду» (чужой, странный). Правдоподобнее версия с чужим, странным поведением — тогда прозвище Чудут означало «чудак», «не такой, как все», и его дали за необычный нрав.

Менее вероятная, но возможная гипотеза — связь с церковным именем Феодот (в просторечии Федот), которое через диалектное стяжение могло превратиться в Чудут. Но это спорно: переход «Фе-» в «Чу-» фонетически редок и не подтверждён массовыми примерами.

Географически фамилия тяготеет к южным и восточным регионам России, где сильнее тюркское влияние, — возможно, к Поволжью или Приуралью. В дореволюционных списках Чудутовы встречаются единично, что говорит о локальном происхождении. Сословно предки могли быть государственными крестьянами или казаками, но точных данных нет. Фамилия не перешла в дворянские роды и не фиксируется в старых боярских книгах.

Итак, Чудутов — скорее всего, потомок человека с необычным, чудаковатым характером, получившего прозвище от диалектного «чуду» (чудной) или от тюркского корня с похожим значением. Модель образования стандартная, а вот основа — редкость, что и делает фамилию узнаваемой.