Фамилия Чуфоров — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В основе, скорее всего, лежит прозвище или имя, образованное от диалектного слова «чуфырь» или «чуфарь». В русских говорах (особенно северных и сибирских) так называли неопрятного, лохматого человека, неряху, иногда — ворчливого старика. Слово звукоподражательное, связанное с фырканьем, сопением или недовольным бормотанием. Таким образом, первый носитель прозвища Чуфор мог получить его за внешний вид или манеру поведения.

Суффикс -ов указывает на стандартную русскую патронимическую модель: Чуфоров — сын Чуфора. Фамилия образована от полной формы прозвища, а не от уменьшительной, что говорит о её относительной древности: в XV–XVII веках так могли записать крестьянина или посадского человека, у которого ещё не было устоявшейся фамилии. Географически фамилия тяготеет к северо-востоку России — встречается в старых переписях Вологодской, Вятской и Пермской губерний, что косвенно подтверждает диалектный характер основы.

Существует и альтернативная версия, но менее вероятная: от тюркского имени Чуфур (вариант Джуфур), которое могло попасть в русскую среду через татарских или башкирских переселенцев. Однако для этой гипотезы нет надёжных письменных подтверждений, а фонетика фамилии (твёрдое «ч» и ударение на первый слог) типична именно для русской, а не тюркской модели словообразования.

Среди однокоренных фамилий — Чуфаров, Чуфиров, Чуфырин. Все они восходят к тому же корню «чуф-», но с разными суффиксами, что говорит о независимом возникновении в разных регионах. Чуфоров — одна из самых редких в этой группе. В дореволюционных источниках фамилия фиксируется в основном в среде государственных крестьян и мещан; дворянских родов с такой фамилией не известно.