Фамилия Чусикова — женская форма фамилии Чусиков, и её происхождение стоит искать в мужском прозвище или имени, лёгшем в основу. Сама фамилия Чусиков образована по типичной русской модели с суффиксом -ов, что указывает на принадлежность к роду человека по имени или прозвищу Чусик. Ключевой вопрос — что означало это исходное слово.

Самая вероятная версия отсылает к диалектному слову «чусик». В русских говорах, особенно северных и сибирских, «чусить» означало «чудить, проказничать, вести себя странно». Соответственно, Чусиком могли прозвать чудаковатого, необычного человека, либо того, кто любил подшучивать и дурачиться. Прозвища с корнем «чуд-» (Чудак, Чудин) широко распространены, и «Чусик» — их фонетически близкий родственник. Менее распространённая, но возможная версия связывает фамилию с тюркским именем Чус (или Чусик), которое могло попасть в русскую среду через татарские или башкирские контакты, но для фамилии на -ов это менее типично, чем славянское прозвище.

С точки зрения словообразования, фамилия Чусиков стоит в ряду таких же «прозвищных» фамилий, как Чудиков, Чудаков, Чухнин. Суффикс -ик в основе (Чусик) указывает на уменьшительную или пренебрежительную форму, что характерно для бытовых прозвищ. Географически фамилия встречается нечасто, но имеет заметную концентрацию в Вологодской и Архангельской областях, что хорошо согласуется с версией о севернорусском диалектном происхождении слова «чусить».

Таким образом, предок носителей фамилии Чусиков, скорее всего, получил своё прозвище за необычное поведение или склонность к чудачествам. Фамилия не имеет отношения к знатным родам и не фиксируется в старых боярских списках — это типичная крестьянская или посадская фамилия, возникшая в XV–XVII веках, когда прозвища массово превращались в родовые имена.