Фамилия Чусина — женская форма фамилии Чусин, и её происхождение связано с прозвищем или нецерковным именем Чуся. Чтобы понять корень, стоит заглянуть в старые русские говоры: «чуся» или «чус» в ряде диалектов означало «чужой», «чуждый», «нездешний», а также могло относиться к человеку со странностями или пришлому. Так могли прозвать переселенца из другой местности или того, кто говорил на непонятном наречии. Модель образования простая: основа Чус- плюс суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — Чусин, то есть сын или потомок Чуси). В русской ономастике этот суффикс — один из самых частых, он формирует «патронимические» фамилии, буквально отвечая на вопрос «чей ты будешь?».

Есть и менее очевидная версия, связывающая фамилию с диалектным глаголом «чусить» — «чудить», «вести себя необычно». В этом случае Чуся — прозвище чудака или человека с причудами. Такие прозвища на Руси давали без злого умысла, скорее как меткую бытовую характеристику. Вариант с «чужаком» выглядит правдоподобнее, потому что в основе лежит более древний корень, встречающийся в других славянских фамилиях (ср. Чужин, Чужаков).

Географически фамилия Чусина (и мужская Чусин) встречается нечасто, но имеет очаги в центральных регионах России — например, в бывших Владимирской и Нижегородской губерниях, где диалектное слово «чуся» было в ходу. В переписных книгах XVII–XVIII веков можно найти крестьян и посадских людей с прозвищем Чуся, что указывает на простонародное происхождение фамилии: дворянских родов Чусиных в родословных книгах не зафиксировано. Таким образом, предки носителей фамилии — скорее всего, вольные или крепостные крестьяне, получившие прозвище за свою «нездешность» или необычное поведение, а затем передавшие его детям как родовое имя.