Фамилия Чынара — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение почти наверняка не связано с исконно русскими корнями. В русской традиции фамилий на -а, -я обычно указывают на женскую линию (типа Кузьмина, Ильина) или на украинское/белорусское происхождение (с ударением на последний слог, как Шевченко, Палий). Но Чынара — совсем другая история.

Скорее всего, фамилия восходит к тюркскому слову «чынар» (или «чинар»), которое во многих тюркских языках (турецком, азербайджанском, туркменском) означает платан — огромное дерево с раскидистой кроной, почитаемое на Востоке как символ долголетия и стойкости. В таком случае фамилия образована от прозвища или имени-пожелания: предка могли назвать Чынаром либо в честь дерева (как символ силы), либо в честь человека, который жил возле знаменитого платана. В некоторых тюркских культурах «Чынар» — это и мужское имя, так что фамилия могла возникнуть от имени отца.

Вторая, менее вероятная версия — связь с иранским или арабским корнем, где «чинар» также обозначает платан, но в русском языке фамилия закрепилась именно в написании через «ы», что характерно для тюркских заимствований (сравните: кызыл, сырт). Фамилия Чынара могла появиться у русских или крещёных татар, башкир, казахов или народов Кавказа, которые перешли на русскую фамильную систему, но сохранили национальную основу.

Поскольку фамилия очень редкая, её носители, скорее всего, сосредоточены в регионах с тюркским населением: Поволжье, Урал, Северный Кавказ или Азия. Суффикс -а здесь не фамильный, а часть корня, поэтому фамилия не склоняется по мужскому роду (Иван Чынара, у Петра Чынары), а по женскому — может склоняться как обычное существительное (Анна Чынара, у Анны Чынары). Сословной принадлежности у фамилии нет: это не дворянская и не крестьянская по происхождению, а скорее поздняя, возникшая в XIX–XX веках при фиксации имён в документах.